如何在 Ubuntu 18.04 上安装 R
本教程的先前版本由 Melissa Anderson 编写。
介绍
R 是一种专门用于统计计算和图形的开源编程语言。在 R Foundation for Statistical Computing 的支持下，它被广泛用于开发统计软件和执行数据分析。作为一种日益流行和可扩展的语言，拥有活跃的社区，R 为特定的研究领域提供了许多用户生成的包，这使得它适用于许多领域。
在本教程中，我们将安装 R 并展示如何从官方 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 添加包。
先决条件
要学习本教程，您需要一台 Ubuntu 18.04 服务器：
- 至少 1GB 内存
- 具有
sudo权限的非根用户
要了解如何实现此设置，请遵循我们的自动化脚本。
一旦具备这些先决条件，您就可以开始了。
第 1 步 — 安装 R
因为 R 是一个快速发展的项目，最新的稳定版本并不总是可以从 Ubuntu 的存储库中获得，所以我们将从添加由 CRAN 维护的外部存储库开始。
注意：CRAN 在其网络内维护存储库，但并非所有外部存储库都是可靠的。请务必仅从受信任的来源安装。
让我们首先添加相关的 GPG 密钥。
- sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
当我们运行命令时，我们将收到以下输出：
OutputExecuting: /tmp/apt-key-gpghome.4BZzh1TALq/gpg.1.sh --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: key 51716619E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg: imported: 1
一旦我们有了可信密钥，我们就可以添加存储库。
请注意，如果您不使用 18.04，您可以从 R Project Ubuntu 列表中找到相关的存储库，以每个版本命名。 Ubuntu 18.04 被命名为 Bionic Beaver，最新版本的 R 是 4.0，因此命名约定为 ubuntu bionic-cran40。
- sudo add-apt-repository 'deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/'
在显示的输出中，您应该识别类似于以下内容的行：
Output...
Get:4 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease [3626 B]
...
Get:22 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ Packages [20.4 kB]
...
现在，我们需要在此之后运行 update 以包含来自新存储库的包清单。
- sudo apt update
在输出中应该有一行类似于以下内容：
Output...
Hit:1 https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu bionic-cran40/ InRelease
...
如果上面的行出现在 update 命令的输出中，我们已经成功添加了存储库。我们可以确定我们不会意外安装旧版本。
此时，我们已准备好使用以下命令安装 R。
- sudo apt install r-base
如果提示确认安装，请按 y 继续。
在撰写本文时，来自 CRAN 的 R 的最新稳定版本是 4.0.1，当您启动 R 时会显示该版本。
由于我们计划为系统上的每个用户安装一个示例包，因此我们将以 root 身份启动 R，以便所有用户都可以自动使用这些库。或者，如果您在不使用 sudo 的情况下运行 R 命令，则可以为您的用户设置一个个人库。
- sudo -i R
Output
R version 4.0.0 (2020-04-24) -- "Arbor Day"
Copyright (C) 2020 The R Foundation for Statistical Computing
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
...
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
>
这确认我们已成功安装 R 并进入其交互式 shell。
第 2 步 — 从 CRAN 安装 R 包
R 的部分优势在于其可用的丰富附加包。出于演示目的，我们将安装 txtplot，这是一个输出 ASCII 图形的库，包括散点图、折线图、密度图、acf 和条形图：
- install.packages('txtplot')
注意：以下输出显示了包的安装位置。
Output...
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
. . .
这个站点范围的路径是可用的，因为我们以 root 身份运行 R。这是使包可供所有用户使用的正确位置。
安装完成后，我们可以加载txtplot：
- library('txtplot')
如果没有错误消息，则库已成功加载。现在让我们用一个例子来付诸实践，这个例子演示了一个带有轴标签的基本绘图函数。由 R 的 datasets 包提供的示例数据包含基于 1920 年代数据的汽车速度和停车所需距离：
- txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = 'speed', ylab = 'distance')
Output +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
120 + * +
| |
d 100 + * +
i | * * |
s 80 + * * +
t | * * * * |
a 60 + * * * * * +
n | * * * * * |
c 40 + * * * * * * * +
e | * * * * * * * |
20 + * * * * * +
| * * * |
0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
5 10 15 20 25
speed
如果您有兴趣了解有关 txtplot 的更多信息，请使用 R 解释器中的 help(txtplot)。
任何预编译包都可以使用 install.packages() 从 CRAN 安装。要了解有关可用内容的更多信息，您可以通过按名称提供的 CRAN 软件包列表找到按名称组织的官方软件包列表。
要退出 R，您可以键入 q()。除非您想保存工作区图像，否则您可以在出现提示时按 n。
结论
在您的服务器上成功安装 R 后，您可能会对 Shiny 服务器上的本指南感兴趣，以将您的 R 代码转换为交互式网页。
有关如何利用不同工具安装 R 包的更多信息，您可以阅读有关如何直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置安装的信息。这将使您能够利用活跃社区的最新成果。